Quimper Communauté est membre de deux syndicats intercommunaux :
:: Le Sidepaq
Le Sidepaq est un syndicat intercommunal qui a pour vocation le traitement et la valorisation des résidus urbains et ruraux et assure l'organisation générale et la rationalisation de la collecte sélective.
:: Le Symescoto
Pour élaborer leur schéma de cohérence territoriale, la communauté d'agglomération de Quimper et les communautés de communes du Pays Fouesnantais et du Pays Glazik se sont regroupées en un syndicat : le Symescoto (syndicat mixte pour l'élaboration du Scot de l'Odet), dont le siège est installé au siège de la communauté d'agglomération Quimper Communauté.